Chercheur Post-doctorant (H/F) « Computational Biology/Cancer Genomics »

Institut Curie Siège
Cette offre est expirée, il n’est plus possible de postuler
Date de clôture
Lieu(x) de travail
Saint-Cloud
Secteur
Centre de Recherche
CDD
L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué d'un hôpital et d'un Centre de Recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une forte représentativité internationale.
L’objectif du Centre de Recherche de l’institut Curie est de développer la recherche fondamentale et d’utiliser les connaissances produites pour améliorer le diagnostic, le pronostic, la thérapeutique des cancers dans le cadre du continuum entre la recherche fondamentale et l’innovation au service du malade.

Contexte
L’équipe Bioinformatique et Génomique Intégrative des Cancers étudie l’hétérogénéité tumorale pour répondre à des questions cliniques importantes. Nous développons au sein du laboratoire des approches génomiques pour étudier différents aspects cliniques de la biologie des tumeurs cérébrales en analysant des données générées à partir d’échantillons de patients. Plus spécifiquement, nous étudions l’hétérogénéité intra-tumorale et spatiale, les interactions avec le microenvironnement, et l’évolution des gliomes.

Les projets sont développés dans un environnement dynamique et collaboratif avec les chercheurs et cliniciens de l’Institut Curie et du réseau POLA (Réseau National POLA pour la prise en charge des tumeurs oligodendrogliales de haut-grade).

Projet de recherche
Nous recherchons un chercheur post-doctorant qui souhaite étudier la complexité de la biologie des tumeurs, particulièrement l’hétérogénéité intra-tumorale/spatiale, en réalisant des analyses bioinformatiques à partir de nouvelles données de séquençages (transcriptomes de cellules uniques et transcriptomique spatiale). Le(a) candidat(e) doit avoir récemment obtenu un doctorat, et avoir développé des stratégies d’analyses de données innovantes et des connaissances importantes dans un ou plusieurs des domaines suivants : génomique, biologie des cancers ou statistiques.

Missions principales

  • Développer et mener un projet de recherche ciblant l’hétérogénéité tumorale
  • Analyse complète de données (qualité, traitement, normalisation, visualisation, interprétation…) à partir de données brutes
  • Analyser des données à l’échelle de la cellule unique (« single cell »)
  • Analyser des données de transcriptomique spatiale
  • Utilisation et développement de méthodes et de stratégies pour évaluer l’hétérogénéité tumorale spatiale des échantillons de tumeurs
  • Caractériser les interactions avec l’environnement tumorale
  • Analyse de données à grande échelle et intégration de différents types de données « omique »

 

Profil recherché

 

Formation et expérience 

  • Thèse en bioinformatique, statistique ou informatique avec des connaissances et un intérêt pour la biologie

 

Compétences et qualités requises

  • Être familier avec le travail sous l’environnement Unix
  • Très bonnes compétences en programmation
  • Maîtrise des outils d’analyses des données de séquençage
  • Expérience d’analyses statistiques avec le logiciel R
  • Une expérience d’analyse de données à l’échelle de la cellule unique est désirable
  • Une compréhension de la biologie cellulaire est un atout ainsi qu’une expérience de collaboration avec des biologiques pour résoudre une question donnée.
  • Doit être motivé(e) et capable de travailler en autonomie
  • Excellente communication verbale et écrite en anglais
  • Esprit d´équipe
  • Toutes nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap.

 

Informations sur le contrat

  • Type de contrat : CDD
  • Durée du contrat : 2 ans
  • Temps de travail : Temps complet
  • Rémunération : selon grille en vigueur
  • Avantages : Restauration collective, prise en charge du titre de transport à 70%, mutuelle d’entreprise

 

Contact

Le(a) candidat(e) doit envoyer (i) une lettre de motivation décrivant ces travaux précédents, ces intérêts et objectifs professionnels, (ii) son CV, et (iii) trois lettres de recommandations par email au Dr Cavalli (florence.cavalli@curie.fr)

 

Date de parution de l’offre : 27 juillet 2021

Date limite des candidatures :30 septembre 2021

Exemple : +33112365489.
Seuls les PDF sont acceptés.