Chercheur Post-doctorant en Bioinformatique/Génomique des cancers (H/F)

Institut Curie Siège
Cette offre est expirée, il n’est plus possible de postuler
Date de clôture
Lieu(x) de travail
Saint-Cloud
Secteur
Centre de Recherche
CDD
L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué d'un hôpital, et d'un Centre de Recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une forte représentativité internationale.
L’objectif du Centre de Recherche de l’institut Curie est de développer la recherche fondamentale et d’utiliser les connaissances produites pour améliorer le diagnostic, le pronostic, la thérapeutique des cancers dans le cadre du continuum entre la recherche fondamentale et l’innovation au service du malade.

Contexte
L’équipe Bioinformatique et Génomique Intégrative des Cancers étudie l’hétérogénéité tumorale pour répondre à des questions cliniques importantes.
Nous recherchons un chercheur post-doctorant qui souhaite étudier la complexité de la biologie des tumeurs, particulièrement l’hétérogénéité temporelle et intra-tumorale, en réalisant des analyses bioinformatiques à partir de données de séquençage. Nous développons au sein du laboratoire des approches génomiques pour mieux comprendre l’évolution des tumeurs ainsi que pour explorer différents aspects cliniques de la biologie des tumeurs cérébrales en analysant des échantillons de patients, spécialement les tumeurs récidivantes.
Les projets sont développés dans un environnement dynamique et collaboratif avec les chercheurs et cliniciens de l’Institut Curie et du réseau POLA (Réseau National POLA pour la prise en charge des tumeurs oligodendrogliales de haut-grade).

Missions principales

  •  Analyse complète de données (qualité, traitement, normalisation…) à partir de données brutes
  •  Utilisation et développement de méthodes et de stratégies pour évaluer l’hétérogénéité tumorale des échantillons de tumeurs
  •  Identifier la méthode et/ou l’analyse statistique la plus appropriée pour identifier les « master transcriptional regulators »
  •  Analyser de données à l’échelle de la cellule unique (« single cell »)
  •  Analyser de données à grande échelle et intégration de différents types de données « omique »
  •  Évaluer la réponse aux traitements en utilisant des données cliniques

Profil du candidat (compétences techniques, linguistiques …)

  • Être familier (ère) avec le travail sous l’environnement Unix
  • Très bonnes compétences en programmation
  • Maîtrise des outils d’analyses des données de séquençage
  • Expérience d’analyses statistiques avec le logiciel R
  • Une expérience d’analyse de données à l’échelle de la cellule unique est désirable
  • Une compréhension de la biologie cellulaire est un atout ainsi qu’une expérience de collaboration avec des biologiques pour résoudre une question donnée.
  • Doit être motivé(e) et capable de travailler en autonomie
  • Excellente communication verbale et écrite en anglais
  •  Esprit d´équipe

Niveau Expérience / diplôme souhaité

  • Thèse en bioinformatique, statistique ou informatique avec des connaissances et un intérêt pour la biologie
  • Le(a) candidat(e) doit avoir récemment obtenu un doctorat, et avoir développé des stratégies d’analyses de données innovantes et des connaissances importantes dans un ou plusieurs des domaines suivants : génomique, biologie des cancers ou statistiques

 

Informations complémentaires

  • Unité U900 : Cancer et Génome : Bioinformatique, Biostatistiques et Épidémiologie
  • Directeur de l’unité :Emmanuel Barillot,
  • Cheffe d'équipe :Florence Cavalli,
  • Localisation du poste : Institut Curie St-Cloud
  • Type de contrat : Contrat à durée déterminée
  • Date de début et durée : à déterminer - 2 ans

Comment postuler

Le(a) candidat(e) doit envoyer

  • une lettre de motivation décrivant ces travaux précédents,
  • ces intérêts et objectifs professionnels,
  • son CV
  • trois lettres de recommandations

par email au Dr Cavalli (florence.cavalli@curie.fr)

Exemple : +33112365489.
Seuls les PDF sont acceptés.