Bioinformaticien dans l’équipe Chromatine et Epissage de l’ARN (M/F)

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Cette offre est expirée, il n’est plus possible de postuler
Date de clôture
Lieu(x) de travail
Orsay
Secteur
Centre de Recherche
CDD
Le Centre de recherche de l’Institut Curie
L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué d'un hôpital et d'un Centre de recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une forte représentativité internationale.
L’objectif du Centre de recherche de l’institut Curie est de développer la recherche fondamentale et d’utiliser les connaissances produites pour améliorer le diagnostic, le pronostic, la thérapeutique des cancers dans le cadre du continuum entre la recherche fondamentale et l’innovation au service du malade.

Description du poste

 

  • Laboratoire

Equipe Chromatine et Epissage de l’ARN dans l’unité d’Intégrité Génomique, ARN et Cancer

Notre équipe vise à déchiffrer le rôle des modifications d'histones et des variants d'histones dans la régulation de l'épissage alternatif du pré-ARNm. L'épissage alternatif est un processus d'ARN dans lequel différents ARNm matures peuvent être obtenus à partir de la même séquence de pré-ARNm, augmentant ainsi la diversité protéique et la capacité d'une cellule à acquérir de nouveaux traits phénotypiques.

Au cours des 20 dernières années, il a été démontré que la chromatine jouait un rôle important dans ce processus hautement régulé, bien que les mécanismes ne soient pas encore entièrement connus. En utilisant les données déjà disponibles ou bientôt développées de transcriptomique et d'épigénomique à l'échelle du génome, nous recherchons des signatures d'épissage dépendant des modifications de la chromatine pour élucider le rôle fonctionnel de ces marques dans la régulation de l'épissage. Différents modèles humains et murins seront utilisés en collaboration avec des leaders dans les domaines de la chromatine, de l'épissage et du cancer.

Voir page web pour plus de détails : https://institut-curie.org/team/luco

 

  • Missions  
    • Analyser des données RNA-seq pour identifier les changements dans l'expression des gènes et l'épissage alternatif dans différents modèles humains et murins
    • Analyser les données épigénomiques de ChIP-seq et CUT&RUN
    • Intégrer des données à l'échelle du génome pour identifier les marques d'histones associées à l'épissage
    • Intégrez les données CLIP-seq et RIP-seq pour identifier les sites de liaison à l'ARN
    • Effectuer une analyse de recherche de motifs d'ARN et d'ADN
    • Analyser les données du TCGA sur le cancer du sein.

 

Profil recherché

  • Formation et expérience 
    • Master ou PhD en Bioinformatique ou similaire
  • Compétences et qualités requises
    • Compétences solides pour la gestion des ensembles de données NGS et expertise dans le développement de pipelines d'analyse
    • Le candidat devra être autonome et débrouillard avec une expérience en programmation et des connaissances en biostatistique.
    • Fort intérêt pour les sciences de la vie.
    • Des connaissances de base en biologie (notamment chromatine, transcription, épissage) seront un plus.
    • Capacité à collaborer avec des chercheurs « banc humide ».

Toutes nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap.

 

Informations sur le contrat

  • Type de contrat : CDD
  • Date de démarrage : Octobre 2022
  • Durée du contrat : 18 mois (renouvelable à 18 mois)
  • Temps de travail : Temps complet– 39h/semaine
  • Rémunération : Selon les grilles en vigueur
  • Avantages : Restauration collective, prise en charge du titre de transport annuel à 70%, mutuelle d’entreprise
  • Localisation du poste : Orsay
  • Référence : 2022-08-3348-BIOINF01

 

Contact

Pour postuler, merci d’envoyer CV et lettre de motivation à Reini Luco : reini.luco@curie.fr

 

Date de parution de l’offre : Août 2022

Date limite des candidatures : Septembre 2022

 

L'Institut Curie est un employeur inclusif respectant l'égalité des chances.

Il s’engage également à appliquer des normes exigeantes en matière d'intégrité de la recherche.

Exemple : +33112365489
Seuls les PDF sont acceptés.